Родился в 1906 году в селении Буртунай Казбековского района. 13 сентября 1942 года был призван Казбековским райвоенкоматом в ряды Советской армии. В январе 1945 года в бою на территории Польши получил ранение и был госпитализирован.
Награжден медалью «За отвагу», дважды орденом Славы III степени, орденом Отечественной войны II степени. После возвращения с войны, долгие годы работал бригадиром колхоза, заведующим фермой, председателем ревизкома.
Скончался Магомед Ахкубеков в 1991 году. Похоронен в родовом селе. В администрации МР «Казбековский район» работает его правнук, глава муниципалитета Гаджимурад Гаджиевич Мусаев.